在求学上，邓亚萍也达到了新的高度，她拥有国内外多所知名高校的学位。2001年，邓亚萍取得了清华大学外语系英语学士的文凭。2002年12月，她获得了英国诺丁汉大学中国当代研究专业硕士学位。2008年，她从英国剑桥大学基督学院毕业，获得土地经济学博士学位。

　　在退役后，邓亚萍担任过多个重要职位。2002年，邓亚萍在国际奥委会道德委员会以及运动和环境委员会两个委员会担任职务。2004年，邓亚萍担任奥运村部副部长兼奥运村办公室副主任。2009年4月16日，邓亚萍正式就任共青团北京市委副书记。2010年9月25日，邓亚萍担任人民搜索网络股份公司总经理。2010年9月26日，邓亚萍出任人民日报社副秘书长、人民搜索(后来更名为“即刻搜索”)总经理。