黄花蒿和青蒿有些相似,两种植物都是菊科蒿属,而且味道相似。但是黄花蒿的头状花序接近球状,花序较小,长宽大概有1.5毫米;而青蒿的头状花序呈半球形,花序较大,直径大概为3-4毫米。黄花蒿的茎下部叶多为三至四回羽状深裂,中部叶多为二至三回羽状深裂,上部叶渐小,常为一回羽状深裂,且叶面绿中透黄,叶裂片轴有狭翼;青蒿的茎下部叶多为二至三回栉齿状羽状深裂,中部叶多为二回栉齿状羽状深裂,上部叶渐小,多为一回栉齿状羽状深裂,且叶面不绿中透黄,叶裂片轴有不甚规则的羽片。而制作青蒿素的植物却并不是青蒿,而是黄花蒿。